Protein–RNA interactions for Protein: Q96KG9

SCYL1, N-terminal kinase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL1Q96KG9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCYL1Q96KG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCYL1Q96KG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCYL1Q96KG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCYL1Q96KG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL1Q96KG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCYL1Q96KG9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCYL1Q96KG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCYL1Q96KG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCYL1Q96KG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms