Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HHIPL1Q96JK4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HHIPL1Q96JK4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HHIPL1Q96JK4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HHIPL1Q96JK4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HHIPL1Q96JK4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HHIPL1Q96JK4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HHIPL1Q96JK4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HHIPL1Q96JK4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HHIPL1Q96JK4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HHIPL1Q96JK4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HHIPL1Q96JK4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HHIPL1Q96JK4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms