Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TMX3Q96JJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMX3Q96JJ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMX3Q96JJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TMX3Q96JJ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMX3Q96JJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TMX3Q96JJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMX3Q96JJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMX3Q96JJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMX3Q96JJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms