Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCPIP1Q96JH7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCPIP1Q96JH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCPIP1Q96JH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCPIP1Q96JH7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCPIP1Q96JH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms