Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms