Protein–RNA interactions for Protein: Q96IK1

BOD1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOD1Q96IK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BOD1Q96IK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BOD1Q96IK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BOD1Q96IK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BOD1Q96IK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BOD1Q96IK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOD1Q96IK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms