Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC4Q96FT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASIC4Q96FT7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ASIC4Q96FT7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC4Q96FT7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC4Q96FT7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASIC4Q96FT7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC4Q96FT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms