Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM11Q96F44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM11Q96F44 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM11Q96F44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM11Q96F44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM11Q96F44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM11Q96F44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms