Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGF29Q96ES7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGF29Q96ES7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGF29Q96ES7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGF29Q96ES7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms