Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN6

MBD6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD6Q96DN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD6Q96DN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD6Q96DN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD6Q96DN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD6Q96DN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD6Q96DN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD6Q96DN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms