Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C18orf8Q96DM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C18orf8Q96DM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C18orf8Q96DM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C18orf8Q96DM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C18orf8Q96DM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C18orf8Q96DM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms