Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MSI2Q96DH6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSI2Q96DH6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSI2Q96DH6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSI2Q96DH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSI2Q96DH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms