Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC45Q96CN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC45Q96CN5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC45Q96CN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC45Q96CN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC45Q96CN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC45Q96CN5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC45Q96CN5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms