Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC47Q96A33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC47Q96A33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC47Q96A33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC47Q96A33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC47Q96A33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms