Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERGIC1Q969X5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERGIC1Q969X5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERGIC1Q969X5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERGIC1Q969X5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERGIC1Q969X5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERGIC1Q969X5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms