Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35B4Q969S0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35B4Q969S0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC35B4Q969S0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC35B4Q969S0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35B4Q969S0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35B4Q969S0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC35B4Q969S0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms