Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA10Q969M2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GJA10Q969M2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJA10Q969M2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA10Q969M2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA10Q969M2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJA10Q969M2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJA10Q969M2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms