Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A1Q93096 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A1Q93096 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A1Q93096 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTP4A1Q93096 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTP4A1Q93096 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTP4A1Q93096 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTP4A1Q93096 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms