Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXT2Q93063 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXT2Q93063 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXT2Q93063 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXT2Q93063 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXT2Q93063 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXT2Q93063 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXT2Q93063 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms