Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMM1Q92871 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMM1Q92871 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PMM1Q92871 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMM1Q92871 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMM1Q92871 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMM1Q92871 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMM1Q92871 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMM1Q92871 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMM1Q92871 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMM1Q92871 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms