Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DHX38Q92620 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DHX38Q92620 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DHX38Q92620 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DHX38Q92620 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX38Q92620 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX38Q92620 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX38Q92620 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms