Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FAM3CQ92520 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM3CQ92520 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FAM3CQ92520 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FAM3CQ92520 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM3CQ92520 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM3CQ92520 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM3CQ92520 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM3CQ92520 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM3CQ92520 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM3CQ92520 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM3CQ92520 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM3CQ92520 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM3CQ92520 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM3CQ92520 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM3CQ92520 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM3CQ92520 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM3CQ92520 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM3CQ92520 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM3CQ92520 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms