Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc6Q924W5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smc6Q924W5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc6Q924W5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc6Q924W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc6Q924W5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smc6Q924W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc6Q924W5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smc6Q924W5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc6Q924W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc6Q924W5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms