Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1aQ921W0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1aQ921W0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp1aQ921W0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp1aQ921W0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp1aQ921W0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp1aQ921W0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp1aQ921W0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms