Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SncbQ91ZZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SncbQ91ZZ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SncbQ91ZZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SncbQ91ZZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SncbQ91ZZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SncbQ91ZZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms