Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek8Q91ZR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek8Q91ZR4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek8Q91ZR4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek8Q91ZR4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek8Q91ZR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek8Q91ZR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek8Q91ZR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek8Q91ZR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek8Q91ZR4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek8Q91ZR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek8Q91ZR4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek8Q91ZR4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek8Q91ZR4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek8Q91ZR4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms