Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms