Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBXQ8WY36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BBXQ8WY36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBXQ8WY36 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBXQ8WY36 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBXQ8WY36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBXQ8WY36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BBXQ8WY36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms