Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPS9Q8WXC6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS9Q8WXC6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPS9Q8WXC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms