Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APH1BQ8WW43 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APH1BQ8WW43 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APH1BQ8WW43 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APH1BQ8WW43 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1BQ8WW43 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APH1BQ8WW43 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APH1BQ8WW43 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms