Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms