Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMCE1Q8WV22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMCE1Q8WV22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMCE1Q8WV22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMCE1Q8WV22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NSMCE1Q8WV22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms