Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARB1Q8WTV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARB1Q8WTV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARB1Q8WTV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARB1Q8WTV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARB1Q8WTV0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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