Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm4cQ8VCD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm4cQ8VCD7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm4cQ8VCD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm4cQ8VCD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm4cQ8VCD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm4cQ8VCD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm4cQ8VCD7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm4cQ8VCD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4cQ8VCD7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms