Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIPC3Q8TF64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC3Q8TF64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC3Q8TF64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIPC3Q8TF64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms