Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTRT2Q8TDY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTRT2Q8TDY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTRT2Q8TDY3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTRT2Q8TDY3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms