Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBP6

SLC25A40, Solute carrier family 25 member 40, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A40Q8TBP6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC25A40Q8TBP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A40Q8TBP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A40Q8TBP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A40Q8TBP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC25A40Q8TBP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A40Q8TBP6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms