Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3IL1Q8TBN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3IL1Q8TBN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IL1Q8TBN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3IL1Q8TBN0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IL1Q8TBN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3IL1Q8TBN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms