Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR48Q8TAF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR48Q8TAF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR48Q8TAF3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR48Q8TAF3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WDR48Q8TAF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR48Q8TAF3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR48Q8TAF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR48Q8TAF3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR48Q8TAF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR48Q8TAF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms