Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcoln3Q8R4F0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcoln3Q8R4F0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mcoln3Q8R4F0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mcoln3Q8R4F0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcoln3Q8R4F0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcoln3Q8R4F0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcoln3Q8R4F0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln3Q8R4F0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms