Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps37cQ8R105 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps37cQ8R105 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps37cQ8R105 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps37cQ8R105 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps37cQ8R105 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps37cQ8R105 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps37cQ8R105 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps37cQ8R105 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms