Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEDD1Q8NHV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEDD1Q8NHV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEDD1Q8NHV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEDD1Q8NHV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEDD1Q8NHV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEDD1Q8NHV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEDD1Q8NHV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEDD1Q8NHV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms