Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP2Q8NFZ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP2Q8NFZ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNIP2Q8NFZ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNIP2Q8NFZ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP2Q8NFZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP2Q8NFZ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms