Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBS1Q8NFJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBS1Q8NFJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS1Q8NFJ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS1Q8NFJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS1Q8NFJ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms