Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPER1Q8NEC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPER1Q8NEC5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CATSPER1Q8NEC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPER1Q8NEC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CATSPER1Q8NEC5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms