Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GLIS3Q8NEA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLIS3Q8NEA6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLIS3Q8NEA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLIS3Q8NEA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GLIS3Q8NEA6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLIS3Q8NEA6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLIS3Q8NEA6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms