Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE31

FAM13C, Protein FAM13C, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13CQ8NE31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM13CQ8NE31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM13CQ8NE31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM13CQ8NE31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM13CQ8NE31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM13CQ8NE31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM13CQ8NE31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms