Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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