Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND76

CCNY, Cyclin-Y, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYQ8ND76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNYQ8ND76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNYQ8ND76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNYQ8ND76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNYQ8ND76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNYQ8ND76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYQ8ND76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNYQ8ND76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNYQ8ND76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNYQ8ND76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNYQ8ND76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms