Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC197Q8NCU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC197Q8NCU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC197Q8NCU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC197Q8NCU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC197Q8NCU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms